下列哪些是铁路运输的缺点？A. 资金投入大B. 建设周期长C. 运输速度快D. 运输成本低E. 灵活性差

本题考查铁路运输的特点，解题思路是明确铁路运输的优缺点，然后逐一分析每个选项是否属于铁路运输的缺点。

• 选项A：铁路建设需要大量的资金用于线路铺设、车站建设、机车车辆购置等方面。例如修建一条高速铁路，其造价非常高昂，涉及到土地征收、桥梁隧道建设等众多费用，所以资金投入大是铁路运输的缺点，A选项符合要求。
• 选项B：铁路建设从规划、设计、施工到验收等一系列过程都需要较长的时间。以一些大型铁路工程为例，可能需要数年甚至十几年的时间才能完成建设，建设周期长会影响铁路的尽早投入使用和发挥效益，属于铁路运输的缺点，B选项符合要求。
• 选项C：铁路运输通常具有较高的运行速度，尤其是高速铁路，能够在短时间内将旅客或货物运输到较远的地方，这是铁路运输的优点，而不是缺点，C选项不符合要求。
• 选项D：铁路运输在大量运输货物和旅客时，单位运输成本相对较低。因为铁路运输可以采用大型的列车编组，提高运输效率，降低分摊到每个运输单位的成本，这是铁路运输的优点，D选项不符合要求。
• 选项E：铁路运输需要按照固定的线路运行，车站的设置也相对固定，不能像公路运输那样灵活地实现门到门的运输服务。例如，一些偏远地区可能没有铁路站点，货物或旅客需要通过其他运输方式进行转运，灵活性差是铁路运输的缺点，E选项符合要求。