题目
PAM 矩阵是基于实际序列的相似度统计构建的,而 BLOSUM 矩阵通过矩阵自乘外推得到。( )A. 对B. 错
PAM 矩阵是基于实际序列的相似度统计构建的,而 BLOSUM 矩阵通过矩阵自乘外推得到。( )
A. 对
B. 错
题目解答
答案
B. 错
解析
本题考查对PAM矩阵和BLOSUM矩阵构建方法的知识点。解题思路是需要准确掌握PAM矩阵和BLOSUM矩阵各自的构建原理,然后根据题目描述判断其正确性。
1. PAM矩阵的构建原理
PAM(Point Accepted Mutation)矩阵是基于进化模型构建的。它是通过对一组已知的同源蛋白质序列进行分析,统计氨基酸之间的突变概率,然后经过一定的数学处理得到的。具体来说,是从一组进化距离较近的同源序列中,计算出每个氨基酸突变为其他氨基酸的概率,再经过迭代和标准化等步骤形成PAM矩阵。
2. BLOSUM矩阵的构建原理
BLOSUM(Blocks Substitution Matrix)矩阵是基于实际序列的相似度统计构建的。它是从一组经过比对的、具有较高相似性的蛋白质序列块(blocks)中,统计氨基酸之间的实际替换频率来构建矩阵的。而不是通过矩阵自乘外推得到。
3. 对题目描述的判断
题目中说“PAM矩阵是基于实际序列的相似度统计构建的,而BLOSUM矩阵通过矩阵自乘外推得到”,这与实际的构建原理完全相反,所以该描述是错误的。